Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms