Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEFF2Q9UIK5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms