Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms