Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS4Q9NQG7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms