Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms