Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDCD1Q96RS6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms