Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD7Q8N8D1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD7Q8N8D1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD7Q8N8D1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD7Q8N8D1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD7Q8N8D1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD7Q8N8D1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms