Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC30Q5VVM6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC30Q5VVM6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms