Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM23BQ5SRD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms