Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI3KQ59H18 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms