Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL19A1Q14993 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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