Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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