Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MADCAM1Q13477 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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