Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YDR274CYDR274C 372 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YGL188CYGL188C 174 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YIL171WYIL171W 330 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 RPC25YKL144C 639 nt4.26□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 GAB1YLR459W 1185 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MRPL3YMR024W 1173 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 IZH4YOL101C 939 nt4.26□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPB8YOR224C 441 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 TIF4632YGL049C 2745 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 KEX1YGL203C 2190 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 ADP1YCR011C 3150 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 CYM1YDR430C 2970 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MIC26YGR235C 702 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YAR030CYAR030C 342 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SEC72YLR292C 582 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 VPS69YPR087W 321 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YPR153WYPR153W 423 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 ARO4YBR249C 1113 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 BBC1YJL020C 3474 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YCR023CYCR023C 1836 nt4.25□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 LAS1YKR063C 1509 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 RSC58YLR033W 1509 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 PRP28YDR243C 1767 nt4.25□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR108CYLR108C 1458 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 TFA1YKL028W 1449 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 TFB3YDR460W 966 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 LPP1YDR503C 825 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 VMA22YHR060W 546 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 GTT1YIR038C 705 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YJR071WYJR071W 369 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YKL177WYKL177W 339 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR202CYLR202C 327 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 GPN3YLR243W 819 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 ERD2YBL040C 660 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YNL171CYNL171C 369 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YNR025CYNR025C 360 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 TMA16YOR252W 537 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 DSS4YPR017C 432 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MRP2YPR166C 348 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 RPG1YBR079C 2895 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 APC1YNL172W 5247 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 NUF2YOL069W 1356 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SSU1YPL092W 1377 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 CDC9YDL164C 2268 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 KAP114YGL241W 3015 nt4.24□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 OAF1YAL051W 3144 nt4.24□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 NGL3YML118W 1518 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MMT1YMR177W 1533 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 PEX21YGR239C 867 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 PER33YLR064W 822 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MDJ2YNL328C 441 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MUM2YBR057C 1101 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 RIM21YNL294C 1602 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SPC105YGL093W 2754 nt4.23□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 FAR10YLR238W 1437 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 DBP5YOR046C 1449 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 HSP30YCR021C 999 nt4.22□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 STE2YFL026W 1296 nt4.22□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 DCV1YFR012W 609 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YGL193CYGL193C 312 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YJR038CYJR038C 363 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 IRC25YLR021W 540 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 PML39YML107C 1005 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YML119WYML119W 1074 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SUI1YNL244C 327 nt4.22□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 PNT1YOR266W 1272 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 ATP20YPR020W 348 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MED8YBR193C 672 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 BRE4YDL231C 3378 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 ENT1YDL161W 1365 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SHE9YDR393W 1371 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SSA2YLL024C 1920 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 PEX30YLR324W 1572 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 HOYDL227C 1761 nt4.22□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 FMP30YPL103C 1407 nt4.21□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SSB1YDL229W 1842 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 PEP5YMR231W 3090 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 YCR015CYCR015C 954 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 YCR050CYCR050C 309 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 THI13YDL244W 1023 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 YDR042CYDR042C 603 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 YGL230CYGL230C 444 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 Q0142Q0142 177 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 PEF1YGR058W 1008 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 HIS6YIL020C 786 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 THI11YJR156C 1023 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 IMP2YMR035W 534 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 SHE1YBL031W 1017 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 PNO1YOR145C 825 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.21□□□□□ -1.74
PUF2Q12221 MNN1YER001W 2289 nt4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms