Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms