Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP11P51784 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP11P51784 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP11P51784 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP11P51784 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP11P51784 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP11P51784 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP11P51784 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP11P51784 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP11P51784 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms