Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARSP41250 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARSP41250 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GARSP41250 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GARSP41250 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARSP41250 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARSP41250 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARSP41250 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARSP41250 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARSP41250 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARSP41250 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARSP41250 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARSP41250 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms