Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP6P35125 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP6P35125 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP6P35125 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP6P35125 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP6P35125 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP6P35125 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP6P35125 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP6P35125 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP6P35125 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP6P35125 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP6P35125 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP6P35125 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP6P35125 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms