Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD10P28358 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD10P28358 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.5 ms