Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms