Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RXRAP19793 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RXRAP19793 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRAP19793 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRAP19793 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRAP19793 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RXRAP19793 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RXRAP19793 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RXRAP19793 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RXRAP19793 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RXRAP19793 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RXRAP19793 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms