Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00271P0C7V0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00271P0C7V0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms