Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSO75390 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSO75390 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSO75390 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSO75390 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSO75390 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSO75390 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSO75390 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms