Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCCD1A6NED2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCCD1A6NED2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCCD1A6NED2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms