Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FCF1Q9Y324 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCF1Q9Y324 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms