Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BGRL2Q9UJC5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BGRL2Q9UJC5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BGRL2Q9UJC5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BGRL2Q9UJC5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BGRL2Q9UJC5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms