Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCIQ9NVI1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCIQ9NVI1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCIQ9NVI1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms