Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPIFA1Q9NP55 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPIFA1Q9NP55 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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