Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms