Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPRD1AQ96P16 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPRD1AQ96P16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPRD1AQ96P16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms