Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC16BQ96JE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms