Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUBCNQ92622 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms