Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STAG3L4Q8TBR4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAG3L4Q8TBR4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms