Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL3Q8N8U3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms