Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNE4Q8N205 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNE4Q8N205 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms