Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms