Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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EXT1Q16394 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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