Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1CQ15572 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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