Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH18Q13634 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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