Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	MHO1	YJR008W	1017 nt		4.69	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	NUP85	YJR042W	2235 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	DOG1	YHR044C	741 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	NIT3	YLR351C	876 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	CSM3	YMR048W	954 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	BCH1	YMR237W	2175 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	TLC1	TLC1	1301 nt		4.68	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	PFK26	YIL107C	2484 nt		4.67	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.67	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	YLR339C	YLR339C	552 nt		4.67	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.67	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	RDL2	YOR286W	450 nt		4.66	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.66	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.66	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.66	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	YIL169C	YIL169C	2988 nt		4.66	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	MNL1	YHR204W	2391 nt		4.65	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.65	□□□□□ -1.66
SMC4	Q12267	RTT109	YLL002W	1311 nt		4.65	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	ARO1	YDR127W	4767 nt		4.65	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	AFT1	YGL071W	2073 nt		4.65	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	INO80	YGL150C	4470 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.64	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	SOH1	YGL127C	384 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	ANB1	YJR047C	474 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	DPB2	YPR175W	2070 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	CHS3	YBR023C	3498 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	ATG11	YPR049C	3537 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	APC11	YDL008W	498 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	VPS64	YDR200C	1815 nt		4.63	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	IKI3	YLR384C	4050 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YAR069C	YAR069C	294 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.62	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	ROG1	YGL144C	2058 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YLR001C	YLR001C	2589 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	GPI10	YGL142C	1851 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	UBP13	YBL067C	2244 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	RGC1	YPR115W	3252 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	MKC7	YDR144C	1791 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	PSF1	YDR013W	627 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	UPS3	YDR185C	540 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	RPS21A	YKR057W	264 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YPL168W	YPL168W	1293 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YPS6	YIR039C	1614 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	GYP6	YJL044C	1377 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	HEH2	YDR458C	1992 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	FMP25	YLR077W	1752 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	SED5	YLR026C	1023 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YBL108W	YBL108W	306 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	YPR003C	YPR003C	2265 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	FAP7	YDL166C	594 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	GPI14	YJR013W	1212 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	RPC37	YKR025W	849 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	TMA10	YLR327C	261 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	HER2	YMR293C	1395 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SMC4	Q12267	ARP4	YJL081C	1470 nt		4.59	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	BMS1	YPL217C	3552 nt		4.59	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	GIS2	YNL255C	462 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	SPA2	YLL021W	4401 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	CHA4	YLR098C	1947 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YPL109C	YPL109C	1974 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	MNN1	YER001W	2289 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YDR526C	YDR526C	471 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YOR338W	YOR338W	1092 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YDL180W	YDL180W	1644 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	SIS2	YKR072C	1689 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	MMR1	YLR190W	1476 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	HBT1	YDL223C	3141 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	GUS1	YGL245W	2127 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	ABP140	YOR239W	1887 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	TFB2	YPL122C	1542 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YHL005C	YHL005C	393 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	ATP4	YPL078C	735 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	NAB6	YML117W	3405 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	RPA135	YPR010C	3612 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	CIT1	YNR001C	1440 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	SSE2	YBR169C	2082 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	ERP6	YGL002W	651 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	CHS2	YBR038W	2892 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	AUS1	YOR011W	4185 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	MNT4	YNR059W	1743 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	VPS41	YDR080W	2979 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	CBT1	YKL208W	816 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	MET7	YOR241W	1647 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	FCF1	YDR339C	570 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	PUG1	YER185W	912 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	COX17	YLL009C	210 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	PEX32	YBR168W	1242 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SMC4	Q12267	FKH1	YIL131C	1455 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SMC4	Q12267	PAU23	YLR037C	375 nt		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.7 ms