Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2C1P98194 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2C1P98194 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms