Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCP4P48539 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCP4P48539 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms