Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms