Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	PHO13	YDL236W	939 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	DCV1	YFR012W	609 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ERV14	YGL054C	417 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	MMS2	YGL087C	414 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SRB5	YGR104C	924 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	TMA19	YKL056C	504 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ADD66	YKL206C	804 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YLR374C	YLR374C	390 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YFR045W	YFR045W	930 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YGR015C	YGR015C	987 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	CDC8	YJR057W	651 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	OAR1	YKL055C	837 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YLR402W	YLR402W	192 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	NCE103	YNL036W	666 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ATG8	YBL078C	354 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	NCE102	YPR149W	522 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YPR174C	YPR174C	666 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	MIH1	YMR036C	1665 nt		3.67	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YTM1	YOR272W	1383 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YER077C	YER077C	2067 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	TRX3	YCR083W	384 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	FMP32	YFL046W	624 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YAE1	YJR067C	426 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ILV5	YLR355C	1188 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ECM8	YBR076W	1065 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	snR37	snR37	386 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.66	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	RKM3	YBR030W	1659 nt		3.65	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.65	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.65	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	GTF1	YGR102C	552 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YGR273C	YGR273C	525 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	UPS2	YLR168C	693 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	CUZ1	YNL155W	825 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	CMR3	YPR013C	954 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	SIP1	YDR422C	2448 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	ALG11	YNL048W	1647 nt		3.65	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	HER2	YMR293C	1395 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	SMF1	YOL122C	1728 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RPA14	YDR156W	414 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	VMA22	YHR060W	546 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	SNL1	YIL016W	480 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YPT7	YML001W	627 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PPA2	YMR267W	933 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	OM14	YBR230C	405 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YCL022C	YCL022C	516 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	SYF1	YDR416W	2580 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PUF2	YPR042C	3228 nt		3.64	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	UGA3	YDL170W	1587 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	BUD27	YFL023W	2391 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	CHD1	YER164W	4407 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	IOC4	YMR044W	1428 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	TRM13	YOL125W	1431 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RMD1	YDL001W	1293 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	COS7	YDL248W	1152 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	COS5	YJR161C	1152 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	AUR1	YKL004W	1206 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PSR1	YLL010C	1284 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	IDP2	YLR174W	1239 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RNA1	YMR235C	1224 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RPS9B	YBR189W	588 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	UBX5	YDR330W	1503 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	NUG1	YER006W	1563 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.63	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	NPL4	YBR170C	1743 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RPP1A	YDL081C	321 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YDR391C	YDR391C	699 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	IMP4	YNL075W	873 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	FYV5	YCL058C	459 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YML020W	YML020W	1995 nt		3.62	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	FAA1	YOR317W	2103 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	UBP6	YFR010W	1500 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	SPO1	YNL012W	1896 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	ALE1	YOR175C	1860 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PAU10	YDR542W	363 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	BUR6	YER159C	429 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PAU11	YGL261C	363 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PAU13	YHL046C	363 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	TIS11	YLR136C	858 nt		3.61	□□□□□ -1.83
ATG12	P38316	PAU4	YLR461W	363 nt		3.61	□□□□□ -1.83

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