Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL1A2P08123 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL1A2P08123 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL1A2P08123 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL1A2P08123 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL1A2P08123 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL1A2P08123 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL1A2P08123 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms