Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms