Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPDYE3A6NKU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE3A6NKU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms