Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARID3CA6NKF2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms