Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO3A2RU48 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms