Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN7Q9Y6W3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN7Q9Y6W3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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